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《报告》也显示，仁爱礁礁区的大型底栖无脊椎动物种群结构出现失衡，非法“坐滩”军舰周边尤为严重。在礁区布设的所有13个生态站位均少见珊瑚礁生态系统中广泛分布的甲壳类、双壳类、腹足类等经济型生物，仅在距离非法“坐滩”军舰较远的RA13站位发现有甲壳类生物。从距离非法“坐滩”军舰较近的RA05、RA06站位分析看，上述经济型生物的栖息密度较其他站位要低。
报告还显示，在仁爱礁礁区散布有渔网等各类人为弃置物。除调查现场观察到有许多菲渔船持续在仁爱礁潟湖周边活动外，所有13个生态调查站位附近的水下或水面均发现有各类人为弃置物，包括渔网、渔线、特殊渔具以及麻绳、塑胶圈、铁饼、玻璃瓶、塑料瓶和木棍等等，一些弃置物有产自菲律宾的标识。特别是在非法“坐滩”军舰东侧海域还发现有一张高度约5米、长度约300米的弃置渔网，部分挂立在海中，部分覆盖、缠绕在珊瑚上，珊瑚大片死亡；在非法“坐滩”军舰北侧和东侧发现有悬浮在海面的浮筒2个，下方用绳索和铁块固定在礁盘上，固定处的珊瑚已全部死亡，此外东侧浮筒水下固定处附近珊瑚礁全部被破坏。
检察机关依职权调取剩余的200页病历资料，初步判断杨某入院抢救48小时内的临床表现基本符合脑死亡的先决条件和临床判定标准。鉴于脑死亡结论性医学诊断具有较高专业性，为准确认定杨某脑死亡的时间，某市检察院委托该院检察技术部门进行技术性证据审查。检察技术部门在全市范围内选聘5名资深神经医学专家，对杨某全部住院病历资料进行专门审查，并形成会诊意见，一致认为：杨某因脑干出血破入脑室引起深度昏迷，具有不可逆性，自2021年7月25日21时22分至宣布临床死亡，临床表现为深昏迷（格拉斯哥昏迷指数为3分）、脑干反射消失、无自主呼吸，符合脑死亡的先决条件和临床判定标准；虽然杨某尸体不复存在，已不具备确认实验及司法鉴定条件，但综合分析病历资料，并结合主治医生建议杨某家属捐献杨某肝脏的事实，可以得出“杨某入院抢救48小时内脑死亡已经发生”的诊断结论。在此基础上，该院检察技术部门对专家会诊意见进行鉴别和判断，出具技术审查意见认为：杨某2021年7月25日16时30分入院，后经两次开颅手术，仍存在不可逆昏迷；7月27日9时30分，杨某病程记录记载自主呼吸消失，瞳孔散大，临床诊断为脑干出血、脑疝、脑干功能衰竭，根据病历资料分析，可以判定杨某入院抢救48小时内脑死亡已经发生。
